Биография :
Родился в деревне Лапени Чаусского района Могилёвской области Республики Беларусь.
Участник гражданской и Великой Отечественной войн. Член ВКП(б).
С 16 февраля 1940 года по 23 октября 1941 года Я.Е. Тимошенко в должности командира 12 стрелкового полка 214 стрелковой дивизии. На 22 июня 1941 года дивизия находилась в Харьковском военном округе. В июле – сентябре действовала в составе 22 армии Западного фронта. В октябре 1941 года, участвуя в оборонительных боях в составе 16 армии, дивизия погибла в окружении под Вязьмой.
С 1 июля 1943 года по 3 сентября 1945 года Яков Ефимович Тимошенко в должности командира 231 стрелковой дивизии 2-го формирования на Дальнем Востоке. Дивизия была сформирована в Приморском крае в августе, под непосредственным руководством ее командира. После формирования дислоцировалась на Дальнем Востоке. В боевых действиях на западе СССР участия не принимала. 22 февраля 1944 года, постановлением №191, полковнику Я.Е. Тимошенко присвоено звание генерал-майор.
9 августа 1945 года с началом боевых действий против Японии и Маньчжурской стратегической операции 231 дивизия находилась во втором эшелоне ударной группировки 1 Краснознаменной армии, 10 августа 1945 года после марша переправилась через реку Шитоухэ, также продвигаясь во втором эшелоне и ведя бои с наносящими удары во флаг японскими частями. В боях в районе Муданьцзяна, дивизией, совместно с 39-й стрелковой дивизией была разгромлена 1-я моторизованная бригада японской армии.
К 25 августа 1945 года закончила сосредоточение на Харбинском направлении, дислоцируясь в районе Яблони. По итогам этих боев дивизия награждена орденом Красного знамени.
После окончания войны Яков Ефимович Тимошенко служил на различных командных должностях в Вооружённых Силах СССР.
